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複製(Ctrl+C)、貼上(Ctrl+V)是電腦文書處理最常使用的功能。令人意外的是,科學家發現蛋白質演化的時候,竟然也採用類似的高效率策略。國立陽明交通大學生化暨分子生物研究所黃介嶸教授研究團隊,最近針對脊椎動物體內「半乳糖凝集素」這一段沒有結構的蛋白質區段進行研究,發現這類蛋白質的功能演化,並不一定是靠精雕細琢調整每個化學零件,而是透過不斷「複製貼上」特定片段,逐步累積出越來越完整的功能。研究團隊指出,若科學家能借鏡這套大自然的程式碼,未來或許可設計出具有特定相分離特性的生醫高分子材料,或是針對異常相分離引起的疾病尋找新的標靶機制。
黃介嶸教授研究團隊指出,半乳糖凝集素這段沒有結構的蛋白,會聚集成像小水滴般的液滴,進而把細胞內的醣分子黏在一起,在身體免疫與細胞溝通中扮演關鍵角色。過去科學家常認為,這種聚集能力高度依賴特定種類的胺基酸,就像黏膠必須使用特定成分,才能提供足夠的黏合力。然而研究團隊比較大量生物資料的半乳糖凝集素後發現,不同生物使用的「材料」其實很不一樣。例如人類的蛋白質較常出現酪胺酸,斑馬魚則較常使用色胺酸,但兩者都能成功發揮凝集的功能,因為重要的不是一定要使用哪一種胺基酸,而是取決於材料重複的數量。黃介嶸教授形容,演化傾向於在蛋白質序列中不斷「複製貼上」相同的氨基酸的片段,也就是演化並沒有執著於在單一胺基酸的強度上鑽牛角尖,而是採取了更簡單有效率的「以量取勝」策略,只要把能發揮作用的小片段重複排列,就能累積出足夠的凝集能力。
黃介嶸教授說,面對生物複雜的生理需求,蛋白質從一個短小的序列出發,直接利用宛如電腦指令「Ctrl+C /
Ctrl+V」的複製貼上機制,不斷疊加這些模組序列。透過單純增加模組重複的次數,不同物種最終都能獨立趨同演化出強大的凝集功能。這種靈活的擴增策略,完美展現了大自然在分子層次上的模組化設計智慧。
這項刊登在《EMBO Reports》的研究,打破了以往認為蛋白質功能必須精準設計的觀點,替未來蛋白質工程與合成生物學提供新的想像。